Derrière l’église se trouve la chapelle Saint-Hubert, un modeste oratoire dédié au saint. Mentionné dès 1271, l’édifice présente une architecture très simple et s’adosse au sud du chœur inachevé. La chapelle actuelle fut consacrée en 1656 par l’archevêque de Sens. Elle fut ensuite le lieu d’un important pèlerinage jusqu’au XIXe siècle.
Son principal intérêt réside dans son décor intérieur polychrome du XVIIe siècle, remarquable par son caractère à la fois foisonnant et populaire. Les murs et le plafond sont entièrement couverts de peintures murales. Dans la partie ouest, celles-ci racontent la légende de saint Hubert. La voûte représente le Christ en majesté ainsi que la colombe du Saint-Esprit. L’ensemble s’inscrit dans un décor architecturé en trompe-l’œil, procédé pictural qui crée l’illusion d’éléments d’architecture. Plusieurs saints tutélaires y sont figurés : Apolline, Geneviève, Antoine, Émérenciène, Fiacre, Grégoire, Firmin, Catherine, Marguerite et Hubert.