Le musée du château de Flers propose un parcours d’exposition consacré à l’histoire du château et de ses propriétaires. La présentation s’appuie notamment sur la mise en valeur des pièces de vie, dans lesquelles peintures, objets et mobilier sont réunis. La découverte des collections est enrichie par différentes propositions, parmi lesquelles une visite multimédia ainsi que des animations destinées aux jeunes publics et aux familles.
Chaque année, une exposition temporaire met en lumière les collections de beaux-arts du musée et permet également de découvrir le travail d’artistes contemporains. L’établissement est labellisé Musée Joyeux – Môm’Art.
Le musée accueille aussi une Micro-Folie, dispositif proposé par La Villette. Il comprend notamment un musée numérique installé dans les salles du château, grâce auquel les visiteurs peuvent découvrir des chefs-d’œuvre de musées nationaux et du territoire. Des casques de réalité virtuelle sont également prêtés au public.
Des livrets pour enfants sont disponibles gratuitement à l’accueil. Depuis 2022, un nouvel espace est consacré aux tout-petits.