L’église d’Habère-Lullin présente deux parties distinctes, différenciées à la fois par leur époque et par leur style. Le chœur date du XIIIᵉ siècle. Cette partie de l’édifice constitue ainsi le témoignage le plus ancien mentionné pour l’église. Le bâtiment a ensuite été agrandi en 1840, dans le style sarde, ajoutant une dimension plus récente à cet ensemble religieux. Cette juxtaposition permet de lire l’évolution de l’édifice à travers deux périodes séparées par plusieurs siècles.
L’église conserve également une fresque représentant l’Annonciation, datée du XVᵉ siècle. Dans l’iconographie chrétienne, l’Annonciation désigne l’annonce faite à Marie de la naissance du Christ. Cette œuvre appartient donc à une période antérieure à l’agrandissement de 1840 et complète l’intérêt historique et artistique du monument. Le chœur médiéval, l’agrandissement de style sarde et la fresque du XVe siècle composent ainsi un ensemble où se rencontrent plusieurs étapes de l’histoire de l’église.