L’Église protestante baptiste de Thonon est un lieu de rassemblement religieux organisé autour de plusieurs temps de rencontre réguliers. Le culte se tient chaque dimanche à 10 heures. Il constitue le principal rendez-vous hebdomadaire de la communauté.
La vie de l’église comprend également des études bibliques, proposées chaque jeudi à 18 h 30. Une réunion de prières est organisée le premier jeudi de chaque mois. Ces rendez-vous complètent le calendrier régulier des célébrations et des échanges religieux.
L’église accueille aussi un groupe de jeunes, qui se réunit un samedi sur deux à 19 heures. Enfin, des études de proximité ont lieu les premiers mardis du mois au Gavot. L’ensemble de ces activités associe célébration, étude de la Bible, prière et rencontres destinées à différents publics. Les informations disponibles présentent ainsi l’édifice principalement à travers les usages religieux et communautaires qui lui sont rattachés.