Le Musée des Beaux-Arts accueille le public du mardi au dimanche, à l’exception du dimanche matin. Les visites sont possibles de 10 h à 12 h et de 14 h à 18 h. Deux jeudis par mois, l’établissement reste ouvert jusqu’à 20 h. Il est fermé le lundi, le dimanche matin, ainsi que les 1er mai, 1er novembre, 25 décembre et 1er janvier.
L’administration reçoit du lundi au vendredi, de 9 h à 12 h et de 14 h à 18 h. L’entrée du musée est gratuite. Des visites guidées gratuites sont proposées en français et en anglais deux dimanches et deux samedis par mois, à 15 h. Les groupes doivent réserver au préalable.
Le musée est accessible par les autoroutes A39 et A36, en prenant la sortie Dole. Il se trouve également à proximité d’une gare TGV, annoncée à deux heures de Paris. Un parking est disponible à proximité, place Barberousse.