À l’origine, l’église était placée sous le vocable de saint Jean-Baptiste. Au XIVe siècle, des travaux d’agrandissement et de rénovation modifièrent son statut : elle devint un centre paroissial et adopta alors pour patron saint Aignan, évêque d’Orléans. Ce changement explique la dédicace actuelle de l’édifice et rattache son histoire à la figure de ce prélat.
Saint Aignan vécut au Ve siècle. Il est présenté comme l’un des pontifes les plus illustres des Gaules et comme le libérateur de la cité orléanaise. Le terme de pontife désigne ici un haut dignitaire de l’Église. La tradition familiale associée au saint est également évoquée à travers les « Aniani », membres de sa famille. Ceux-ci seraient établis à Sabaria, une ville lointaine de l’Empire située en Pannonie. Cette province romaine, conquise par Auguste, correspond à la Hongrie méridionale dans l’Europe actuelle.
