Le site archéologique Aquae Segetae, dont le nom signifie « les eaux de Segeta », fut l’une des cinquante-deux villes d’eau de l’Empire romain. Situé sur la route « César », qui reliait Sens à Orléans, il constitua un important lieu de pèlerinage, notamment à l’apogée du site, au IIe siècle après J.-C.
Les vestiges aujourd’hui conservés à Sceaux-du-Gâtinais correspondent au sanctuaire monumental de cette ville. Ils comprennent une vaste cour cultuelle, c’est-à-dire un espace dédié aux pratiques religieuses, bordée de galeries à colonnades. Un bassin, également nommé « nymphée », recueillait les eaux d’une source sacrée. Dans le cadre du culte rendu à la déesse Segeta, associée notamment à la fertilité, les pèlerins déposaient des offrandes dans l’espoir d’obtenir une guérison.
Ces vestiges ne représentent qu’une partie de l’ancien ensemble. Sous le sol subsistent encore les témoins d’une ville romaine plus vaste et plus complexe que ne le laissent apparaître les éléments actuellement visibles.