Le site de Beffery est attesté comme le siège d’un habitat très ancien. À la fin du XIIIe siècle, deux frères y sont mentionnés sous les noms d’« Amanevus et Bernardus de Becferri ». Durant les guerres de Religion, l’église a beaucoup souffert du vandalisme huguenot.
L’édifice présente un plan intérieur simple, avec une nef unique, entièrement voûtée et dépourvue de bas-côtés. Au fond de la nef se trouve une statue de saint Étienne. Dans le chœur, un autel en marbre blanc se détache sur le fond circulaire de l’église.
La voûte a été peinte par le peintre italien Mazutti. Sur un ciel bleu, trois chœurs d’anges semblent veiller sur la terre. Au sommet de la composition, une colombe paraît l’imprégner de l’esprit divin. Deux fenêtres éclairent l’ensemble et contribuent à la mise en valeur du décor peint.
À l’arrière de l’église, un cadran solaire complète la découverte de l’édifice.
