Seul vestige du couvent des Dominicains fondé à Agen en 1249, l’église Notre-Dame des Jacobins a été édifiée dans la seconde moitié du XIIIe siècle. Elle constitue un monument du début du style gothique.
L’édifice présente une disposition originale composée de deux nefs juxtaposées. Celles-ci sont séparées par une épine formée de trois piliers, qui structure une vaste salle rectangulaire. Cet aménagement permettait d’accueillir la foule venue écouter les prédications des religieux dominicains. L’église conserve également des traces importantes de son décor d’origine, qui sont réapparues lors de la dernière restauration.
Par son histoire, elle est liée à plusieurs événements marquants de la vie agenaise. Le 9 août 1279, une cérémonie s’y déroula à l’occasion de la restitution officielle de l’Agenais à l’Angleterre par Philippe le Hardi. En 1585, la reine Margot s’y installa et transforma l’église en citadelle. Plus tard, en mars 1789, les Cahiers de doléances de la Révolution destinés à Agen furent rédigés dans le couvent.