Dans un contexte dâessor industriel et de forte croissance dĂ©mographique, la construction dâune deuxiĂšme Ă©glise devient nĂ©cessaire Ă Flers, en complĂ©ment de lâĂ©glise Saint-Germain. LâĂ©difice est bĂąti dans le haut de la ville, alors en pleine expansion. Ćuvre de lâarchitecte Victor Ruprich-Robert, qui jouit Ă cette Ă©poque dâune certaine notoriĂ©tĂ©, lâĂ©glise Saint-Jean-Baptiste est achevĂ©e et consacrĂ©e en 1864.
Le bĂątiment adopte un plan classique en forme de croix latine, orientĂ© vers lâOrient conformĂ©ment Ă la tradition chrĂ©tienne. Son aspect extĂ©rieur associe un portail nĂ©o-roman Ă un clocher nĂ©o-gothique, dans un ensemble dĂ©crit comme relativement harmonieux. Au-dessus du porche, un mĂ©daillon porte le monogramme du Christ. Il est entourĂ© des symboles des quatre Ă©vangĂ©listes : lâaigle, le lion, le bĆuf et lâange. Les petites portes latĂ©rales sont surmontĂ©es de reprĂ©sentations de deux figuiers, lâun stĂ©rile et lâautre fertile, rappelant la vocation de la vie chrĂ©tienne.
Lâornementation intĂ©rieure sâinspire principalement du monde vĂ©gĂ©tal. Au plafond du chĆur, une fresque reprĂ©sente le Christ en majestĂ©, ou Christ Pantocrator, selon une iconographie dâinspiration byzantine. VĂȘtu Ă lâimpĂ©riale et assis sur un trĂŽne, il enseigne, deux doigts levĂ©s, tout en prĂ©sentant le livre de la parole de Dieu. Une mandorle dorĂ©e souligne sa majestĂ© et son rayonnement. Ă la croisĂ©e de la nef et du transept, des mĂ©daillons figurent plusieurs objets de lâAncien Testament, notamment le chandelier Ă sept branches, lâarche dâalliance et les tables de la Loi.
Les vitraux, peints par Mazuet, peintre caennais, prĂ©sentent des couleurs variĂ©es. Ceux du chĆur racontent la vie de saint Jean-Baptiste, de sa naissance Ă sa dĂ©collation. Dâautres Ă©voquent la vie de la Vierge, lâAssomption de Marie et la RĂ©surrection du Christ. Dans les bas-cĂŽtĂ©s, les compositions illustrent les commandements de Dieu et renvoient Ă plusieurs passages de lâAncien et du Nouveau Testament.
ClassĂ©es monuments historiques, les orgues sont lâĆuvre de Joseph Merklin. Elles ont Ă©tĂ© rĂ©cemment restaurĂ©es par la mairie de Flers. Leur titulaire actuel est Michel Louvel.