L’église Saint-Germain s’inscrit dans l’histoire ancienne de Culles-les-Roches, un village qui conserve les traces de plusieurs périodes successives. Le territoire possède notamment un site préhistorique ainsi que des vestiges attribués aux époques gauloise, gallo-romaine et mérovingienne. Au Moyen Âge, Culles-les-Roches dépendait de la châtellenie de Saint-Gengoux-le-Royal. Une châtellenie constituait alors un territoire placé sous l’autorité d’un château et de son détenteur.
C’est sous l’influence de Cluny que l’église fut construite au XIe siècle. Elle est placée sous le vocable de Saint-Germain, c’est-à-dire dédiée à ce saint. Germain naquit près d’Autun vers 496 et mourut vers 576. Il fut évêque de Paris. La construction de l’édifice s’insère ainsi dans le contexte médiéval du village et dans l’influence exercée par Cluny, tout en rappelant les liens historiques de ce territoire avec la région d’Autun.
