L’église Saint Jean-Baptiste a été édifiée en 1668. Trente ans plus tard, en 1698, l’édifice s’écroula, entraînant la nécessité d’une reconstruction. Celle-ci fut engagée à partir de 1729, selon les plans de Pierre Sénès. Cette seconde étape constitue un moment majeur de l’histoire du bâtiment, dont la construction s’inscrit ainsi dans deux périodes distinctes : l’édification initiale au XVIIe siècle, puis la reconstruction entreprise au XVIIIe siècle après l’effondrement.
L’église connut ensuite une nouvelle période de destruction en 1793, lors du siège de Toulon. Elle fut alors dévastée et son mobilier détruit. Le terme « mobilier » désigne ici l’ensemble des éléments et objets qui accompagnaient l’édifice religieux. Ces dégradations ont donc touché à la fois le bâtiment lui-même et les biens qui se trouvaient à l’intérieur. L’histoire de l’église est ainsi marquée par sa reconstruction après l’effondrement de 1698, puis par les dommages subis pendant les événements de 1793.