Le square Agricol Perdiguier correspond à un ancien jardin et à un cloître de l’abbaye bénédictine Saint Martial, attestés au Moyen Âge. Un cloître est un espace généralement organisé autour d’une cour, associé à la vie d’une communauté religieuse. Dans ce cas, le jardin et le cloître formaient donc une partie de l’ensemble monastique lié à l’abbaye. Après la Révolution, le site a été désaffecté et a perdu sa fonction religieuse. Il a ensuite connu une nouvelle orientation au tout début du XIXe siècle, lorsqu’il est devenu un jardin botanique. Cette transformation s’est réalisée sous l’impulsion d’Esprit Requien, botaniste. Le lieu conserve ainsi la trace de plusieurs étapes de son histoire : son appartenance médiévale à une abbaye bénédictine, sa désaffectation après la Révolution, puis sa reconversion en espace consacré à la botanique.