La synagogue de Chablis est installée dans une maison à deux étages dont la construction remonterait au XVIe siècle. Inscrite à l’inventaire supplémentaire des Monuments historiques, elle a fait l’objet d’une restauration en 2006 et 2008, sous l’impulsion de William Fèvre. Les murs ont été redressés et consolidés par une entreprise de maçonnerie, qui a réemployé les pierres d’origine après leur éboulement. Une équipe de compagnons du Tour de France a également réalisé l’ensemble des boiseries en chêne massif.
Le rez-de-chaussée accueille une salle d’exposition retraçant l’histoire mondiale des hommes de la Torah, ainsi qu’un mikveh. Ce terme désigne un bassin destiné aux bains rituels. À l’étage se trouve une salle conçue pour la prière, l’étude et diverses réunions. Les deux niveaux sont reliés visuellement par une étoile de David ajourée, en chêne massif, aménagée dans le plancher. Aujourd’hui, la synagogue constitue un lieu culturel où sont régulièrement programmées de nombreuses expositions artistiques.