Le nom de Jouy-en-Josas s’explique par une évolution toponymique destinée à distinguer ce lieu d’autres villages portant le même nom. « Jouy » dérive du terme latin *Gaudium*, qui signifie « joie ». Cette origine latine rappelle l’ancienneté du nom, sans toutefois fournir d’indication sur l’histoire particulière du village lui-même.
La dénomination « Jouy » n’étant pas suffisamment précise, on lui adjoignit ensuite le nom de la division ecclésiastique dans laquelle il se trouvait. Cette précision correspond au terme « Josas », ajouté vers le XVe ou le XVIe siècle. Le nom actuel associe ainsi un héritage lexical latin, conservé dans la forme « Jouy », et une référence à l’organisation ecclésiastique ancienne, exprimée par « Josas ». Cette évolution permettait de différencier le village des autres localités homonymes.